50至60年代的挑战在50年代，圣保利虽然在联赛中取得过不俗成绩，但始终未能超越汉堡体育俱乐部进入60年代，由于竞争加剧，圣保利被不来梅沙洲和奥斯纳布吕克超越，成绩出现下滑1963年，德国足球职业联赛联邦联赛成立，圣保利未能直接晋级，而是进入了第二级联赛德国北方地区联赛70至80年代的。

41 2001年，圣保利获得德国乙级联邦联赛第3名，第4次升入甲级42 2002年，位居德甲榜尾的圣保利主场21战胜拜仁慕尼黑，被冠以“世界俱乐部杯冠军战胜者“Weltpokalsiegerbesieger称号43 2006年，以丙级队的身份在德国杯中43和31分别战胜柏林赫塔和云达不莱梅杀进德国杯四强，不过在半决。

在50年代，圣保利虽然在联赛中取得过不俗成绩，但始终无法超越汉堡体育俱乐部进入60年代，俱乐部面临竞争加剧，被不来梅沙洲和奥斯纳布吕克超越，成绩下滑1963年，德国足球职业联赛联邦联赛成立，圣保利未能直接晋级，转而进入第二级联赛德国北方地区联赛直到1977年，圣保利才在乙级联邦联赛中夺冠升。

20102011赛季德甲第28轮圣保利主场对阵沙尔克04的比赛进行到第88分钟，圣保利拥趸用啤酒瓶砸到边裁颈部致使比赛被迫腰斩，一周后德国足协对圣保利俱乐部予以重罚北京时间2011年4月8日，德国足协在其官网发布公告称，4月23日圣保利主场对阵不来梅的比赛，将禁止任何球迷入场观战，这是德国足协近40年对主场球迷滋事做出的最。